天主教香港教區表示，不提倡在校園強制驗毒，擔心造成學生標籤效應，並希望在驗毒的同時，當局有配套輔導措施。教育局副局長陳維安表示，會聽取他們的意見，又指，仍與學校商討落實校本驗毒計劃的細節。

        天主教香港教區主教湯漢表示，不提倡學校參與自願驗毒計劃。天主教社會傳播處主任容若愚指，並非基於宗教原因，而是行政及倫理上有問題，例如驗毒的方法及配套並不清晰，亦不可以當學生是罪犯。他認為，天主教沿用的全人教育方式，可以預防學生接觸毒品，但強調教區只對自願驗毒計劃有保留，絕對支持政府的禁毒抗毒工作。

        而由於天主教香港教區不提倡在校園驗毒，令原本同意參與大埔區校本驗毒計劃的恩主教書院，需要重新考慮是否參加。有恩主教書院家長表示，目前訊息不清，希望校方在開課前，向家長解釋進展。

        教育局副局長陳維安就表示，政府會繼續聽取教區的意見，強調自願驗毒只是打擊青少年吸毒的其中一個方法。