日本政府決定，不對北韓領導人金正日去世表示哀悼。日本傳媒說，政府決定不表示正式哀悼的原因，是由於綁架問題遲遲未得到解決，政府考慮到國內輿論而對北韓表示出毅然的態度。

        但報道說，一貫與日本聯手的美韓兩國已表示了哀悼，僅日本拿出強硬態度的話，將導致北韓增加對日反感，甚至可能給綁架問題等日朝關係，造成負面影響，而日本民主黨內，也有人對此表示擔憂。

        1994年金日成去世時，當時的日本首相村山富市直接從外出訪問地，表達哀悼，發去唁電。