國務院總理溫家寶27日主持常務會議，對溫州和諧號列車相撞事故死者表示深切哀悼，要求嚴肅、認真調查及處理，而且調查工作要公開、透明，向社會公布，給群衆一個真誠負責任的交代。
另外，溫州列車事故國務院調查組全體會議28日上午召開，上海鐵路局長發言稱，經初步調查顯示，由於溫州南站信號燈設備存在缺陷，應該顯示綠燈的時候顯示紅燈，沒有給後車提供應有的信號，相關調度人員也沒有發出預警，引發相撞事故。
上海鐵路局局長安路生28日說，據初步分析，事故是由於溫州南站信號設備在設計上存在嚴重缺陷，遭雷擊後故障，導致本應顯示為紅燈的區間信號機錯誤顯示為綠燈。
他分析，故障後，值班人員沒有意識到信號可能錯誤顯示，安全意識敏感性不強；而溫州南站值班人員對新設備關鍵部位性能，不了解，沒有及時發現和處置，暴露出鐵路部門對職工的教育培訓不到位。
安路生批評鐵路部門，事故反映出的設備品質、人員素質、現場控制等問題，說明部門的安全基礎還比較薄弱，這些問題反映出部門的安全管理不到位。
他說，存在設計缺陷的信號設備，由北京一家研究設計院設計，2009年9月28日投入使用。
