天主教香港教區就《校本條例》進行上訴，終審法院較早前作出判決，駁回教區的上訴。天主教香港教區榮休主教陳日君樞機表示，就《校本條例》司法覆核敗訴，他會絕食3日以表達悲哀。

        陳日君對於《校本條例》被終審法院駁回，表示遺憾，他會絕食3日以表達對此感到悲哀，期間只會喝水和領聖體。他表示，尊重終審法院裁決，但不認為教區做錯。

        陳日君又強調，從來沒有說過上訴駁回，便會停辦所有天主教學校，相信家長不會容許，亦不會以公民抗命形式，不遵守新法辦學，因為政府一定會收回辦學權。

        他又重申，《校本條例》嚴重損害教區的辦學權，將辦學權下放學校，由法團校董會取代教區教學，是一個徹底及事關重要的改變，變相令教區喪失辦學權，亦形成自己監管自己的情況，存在利益衝突。

        天主教香港教區就《校本條例》進行司法覆核，終審法院駁回教區的上訴。判辭指出，教區仍可自由委任法團校董會的大部分成員，維持辦學理念，學校宗教活動沒有被削弱，《校本條例》沒有違反《基本法》。教區對判決感到失望及遺憾，但表明不會放棄辦學權。